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武漢電泳設(shè)備中電泳出現(xiàn)拖尾現(xiàn)象,英文成為smear,就是彌散。其原因,主要從以下兩個(gè)方面考慮:
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1、PCR產(chǎn)物自身原因:
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往往由于酶量過多或酶的質(zhì)量差,dNTP濃度過高,Mg2+濃度過高,
退火溫度過低,循環(huán)次數(shù)過多,而造成PCR的非特異性產(chǎn)物過多。
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對策:
①減少Taq酶的量,或調(diào)換另一來源的酶。
②減少dNTP的濃度。
③適當(dāng)降低Mg2+濃度。
④增加模板量,減少引物的用量,減少循環(huán)次數(shù),提高退火溫度。
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2、電泳體系的問題:
(1)電泳緩沖液TAE或者TBE的污染,建議更換緩沖液。
(2)上樣時(shí)樣品漂了,建議增加上樣緩沖液的用量,以及小心加樣。
(3)電壓太高。
(4)適當(dāng)把你的膠的濃度加大。(根據(jù)你的片斷大小而定)
(5)觀察你的marker是否也存在拖尾現(xiàn)象,作為對照。
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PCR拖尾及假陽性的原因及對策
拖尾現(xiàn)象:產(chǎn)物在凝膠上呈Smear狀態(tài)。
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原因:
1.模板不純
2.Buffer不合適
3.退火溫度偏低
4.酶量過多
5.dNTP、Mg2+濃度偏高
6.循環(huán)次數(shù)過多
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對策:
1.純化模板
2.更換Buffer
3.適當(dāng)提高退火溫度
4.適量用酶
5.適當(dāng)降低dNTP和鎂離子的濃度
6.減少循環(huán)次數(shù)
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假陽性
現(xiàn)象:空白對照出現(xiàn)目的擴(kuò)增產(chǎn)物
原因:
靶序列或擴(kuò)增產(chǎn)物的交叉污染
對策:
1.操作時(shí)應(yīng)小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣槍內(nèi)或?yàn)R出離心管外;
2.除酶及不能耐高溫的物質(zhì)外,所有試劑或器材均應(yīng)高壓消毒。所用離心管及加樣槍頭等均應(yīng)一次性使用。
3.各種試劑最好先進(jìn)行分裝,然后低溫貯存
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武漢電泳設(shè)備運(yùn)行中出現(xiàn)的問題要及時(shí)應(yīng)對,有因有果,找對方法一定可以很好解決電泳設(shè)備中電泳出現(xiàn)拖尾現(xiàn)象!